大黄鱼全基因组序列图谱绘制完成

2011-08-06来源 : 互联网

本报讯浙江省科技厅、上海市科委1月30日在我国大黄鱼故乡——舟山市共同对外宣布:由浙江海洋学院、复旦大学、上海交通大学等单位联合组成的大黄鱼基因组计划项目组,已圆满完成大黄鱼的全基因组测序、组装和序列图谱绘制。

研究结果表明,大黄鱼基因组包含48条染色体,全基因组大小在750M左右。抽提大黄鱼基因组DNA后,将其破碎成小片段分别测得基因序列,使用16个pair-end文库和15个mate-pair文库,经过一系列序列拼接组装,得到有效数据70G,测序深度90x,草图覆盖大黄鱼基因组序列85%以上。

据项目组**,上海交通大学刘赟副教授介绍,该项目研究采用***测序技术,依托Illuminar公司的GenomeAnalyzerIIx平台,成功进行了大黄鱼全基因组测序,绘制了大黄鱼基因组图谱。项目组将在大黄鱼基因组草图数据整理完成后,供全社会共享。

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