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统的科研项目管理结构呈星型分布，科研处是**中心，所有下行信息通过科研处向科研人员发布，上行信息通过科研处整理供上级和其他管理部门利用。随着信息技术的广泛应用，分布式结构的网络化管理模式出现，科研项目管理层次减少、人员规模削减，组织结构趋于扁平化，紧凑而富有弹性。
科研处、各院系以及广大科研人员既是信息的发布者，又是信息的利用者，只是权限有所差别。因此应充分重视和做好信息系统实施与管理制度和管理模式的匹配工作，信息系统仅是内部管理制度和业务流程在计算机环境中的载体，内部管理制度是否健全、是否得到严格执行，直接决定信息系统建设的成败。解决信息系统实施与运行管理脱节的问题，加速科研管理模式的转型，将科研管理部门从“收发室”工作中解放出来，把工作重心放在宏观管理上。
同时，管理信息化为科研管理人员的学习和提高提供了更好的条件、更大的空间和时间自由度、更灵活的方式，管理人员将从传统的经验型管理者转变为学习型管理者。管理人员的不断学习有助于改革组织本身，那就是通过培养弥漫于整个组织的学习气氛，充分发挥管理人员的**性思维能力，建立一种有机的、高度柔性的、扁平化的、符合人性的可持续发展的组织。
